1979年12月22日，经中共云南省委云复［1979］214号文件《对开办省民族干部农业科学技术学校的批复》：为了加速培训民族干部，适应四个现代化的需要，省委同意成立“云南省民族干部农业学校”。

1986年8月，考虑到培训民族干部的范围已逐步扩大，不再只局限于农业技术的范围。学校建议改名为“云南省民族干部学校”。1989年省计委云计查（88）43号文件、云南省编制委员会云省编字[1989]第59号文件《关于云南省民族干部农业学校更名为云南省民族干部学校的函》同意将“云南省民族干部农业学校”改名为“云南省民族干部学校”。

1988年11月1日，学校正式向民委申请将“云南省民族干部学校”转办为“云南民族中等专业学校”。

1991年9月24日云南省教育委员会、云南省计划委员会云教计字（91）第094号《关于“云南省民族干部学校”、“红河州民族干部学校”改建为普通中等专业学校的批复》中同意：1.云南省民族干部学校改建为“云南省民族中等专业学校”，属全日制普通中等专业学校，学校隶书关系不变，仍由云南省民委主管。

1998年2月20日，云南省教委以云教职字〔1998〕第004号文《关于认定省民族中专学校等五所学校为合格普通中等专业学校的通知》，认定学校为合格普通中等专业学校，从此，学校的整体办学水平迈上了一个新台阶，为学校今后的发展奠定了坚实的基础。

2000年10月学校成立了评估验收工作领导小组，在时间紧、任务重的情况下，全校上下团结一心，群策群力，通力协作，发扬艰苦奋斗，吃苦耐劳的精神，按时保质地完成了各科室的材料报送和自评工作。2001年8月27日我校正式被省政府认定为“省（部）级重点中专学校”，同年11月9日，学校举行了隆重的揭牌庆典仪式。

2003年10月17日，省教育厅专家组对学校申报国家级重点中等专业学校进行了复评，对学校软硬件办学条件进行了全面检查和评估，复评分为93分，名列云南省新申报国家级重点中等专业学校中的第五名。省教育厅复评后推荐学校为国家级重点中等专业学校，并上报教育部审定验收。12月底，我校申报国家级重点中等专业学校的材料顺利通过了教育部专家组的审定。教育部教职成厅[2004]1号《教育部办公厅关于公布新调整认定的首批国家级重点中等职业学校名单的通知》，云南省教育厅云教职[2004]7号《关于转发＜教育教育部办公厅关于公布新调整认定的首批国家级重点中等职业学校名单的通知＞的通知》，认定学校为国家级重点中等职业学校。

由于学校办学成果显著，在云南省职业学校和西部民族类职业学校中具有重要地位和代表性，经过严格的审核，国家民委把学校列为全国仅有的两所“民族地区职业教育示范基地”之一，2007年7月5日国家民委吴仕民副主任和云南省政府刘平副省长亲临学校为示范基地揭牌。

根据省政府办公厅的统一安排部署，在省委、省政府及省民族宗教委、省发改委、省教育厅的关心支持下，3月27日上午，省民族中专建设项目开工仪式在二校区举行，标志着省民族中等专业学校改扩建和民族职业学院组建工作进入快车道。

云南省首批7所省属公办学历教育学校归口管理交接仪式在省教育厅举行，标志着我校正式由省民宗委为划归省教育厅主管。

2023年9月1日，根据云教发[2023] 55 号文件精神，学校整体并入云南文化艺术职业学院。